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基因芯片
簡(jiǎn)要描述：
基因芯片廣泛用于模式物種的DNA、RNA和表觀遺傳等研究。豐核信息提供SNP芯片、RNA芯片、甲基化芯片分析服務(wù)，涵蓋人類和主要模式物種。
更新時(shí)間：2024-08-01
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廠商性質(zhì)：其他
| 項(xiàng)目分類 | 名稱 | 描述 |
| Illumina SNP芯片 | Human omni-zhonghua-8 beachip | 包含90萬個(gè)位點(diǎn) |
| Agilent表達(dá)譜芯片 | Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8×60K V2 | 涵蓋50,599條轉(zhuǎn)錄本信息 |
| Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8×60K | 涵蓋55,681條轉(zhuǎn)錄本信息 | |
| Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8×60K | 涵蓋30,003條Entrez Gene RNAs | |
| Agilent miRNA芯片 | Agilent Human miRNA Array V19.0 | 覆蓋2006個(gè)人類相關(guān)miRNA |
| Agilent Rat miRNA Arrary V19.0 | 覆蓋719個(gè)大鼠相關(guān)miRNA | |
| Agilent Mouse miRNA Array V19.0 | 覆蓋1247個(gè)小鼠相關(guān)miRNA | |
| Agilent 定制miRNA Array V19.0 | 可以定制數(shù)據(jù)庫包含的各個(gè)物種的相關(guān)miRNA | |
Illumina人DNA甲基化芯片服務(wù) | IlluminaInfinium Human Methylation450 BeadChip | 包含了450,000多個(gè)甲基化位 |
數(shù)據(jù)分析（以miRNA芯片分析為例）
標(biāo)準(zhǔn)分析
芯片預(yù)處理與標(biāo)準(zhǔn)化；
篩選差異表達(dá)microRNA；
microRNA聚類圖、火山圖以及熱圖等；
microRNA靶基因預(yù)測(cè)，基于多數(shù)據(jù)庫整合的靶基因預(yù)測(cè)以及上海豐核自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的預(yù)測(cè)軟件同時(shí)識(shí)別；
對(duì)預(yù)測(cè)的microRNA的靶基因進(jìn)行GO富集分析通路富集分析等。
個(gè)性化分析
1.microRNA網(wǎng)絡(luò)分析：microRNA靶基因失調(diào)網(wǎng)絡(luò)；microNRA功能協(xié)同作用網(wǎng)絡(luò)。
2.microRNA與其他芯片整合分析：與lncRNAs芯片結(jié)果聯(lián)合分析（ceRNA Analysis）；與mRNA芯片整合分析；與DNA甲基化芯片結(jié)果聯(lián)合分析。
3.與臨床數(shù)據(jù)整合分析
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